1988년 06월 13일

종로구 사직동 304-43 체신부 교육센타(지하2층 지상7층)를 예배당으로 사용할 목적으로 매입 이전함

1988년 09월 11일

교회명을 사직동교회에서 양의문교회로 변경

1988년 09월 18일

김세빈, 김재현, 유병국, 정귀철, 김영식 집사 안수 / 윤은섭, 이명정 권사 취임 / 임상희 명예권사 추대

1988년 10월 06일

한상균 전도사 독노회에서 송용조 목사에게 안수받아 부목사로 취임

1989년 03월 20일

대한예수교장로회 독노회에서 송용조 목사에게 본 교회 당회장직 위임

1989년 03월 21일

서울 양의문교회에서 회집된 독노회에 소속한 교회들이 고신 교단의 각 지역 노회에 가입 청원하기로 결정됨에 따라 본 교회는 서울노회(고신)에 가입함

1990년 02월 22일

김남수 전도사가 타 교단에서 안수 받아 부목사가 됨

1990년 02월 25일

송인헌, 임필숙, 이경희, 이건영, 김춘자 권사 취임 / 김우산 명예권사 추대

1990년 06월 28일

한상균 목사 인천 인송교회 개척을 위해 사임

1991년 10월

필리핀 바야타스에 최무림 선교사를 통하여 바야타스 평화의 교회를 개척

1992년 08월

송경부 목사 양의문교회에서 미국웨스턴 장로교회에 선교사로 파송

1992년 11월 15일

정하곤 전도사 고려개혁 경기노회에서 안수 받아 부목사로 취임

1992년 12월

고신 서울노회가 양분됨에 따라 본 교회가 소속한 서울노회(개혁측)가 주축이 되어 고려개혁총회가
설립되면서 서울노회에서 경기노회에 소속하게 됨

1995년 07월 12일

정하곤 목사 인천 사랑교회 개척을 위하여 사임

1995년 09월 17일

백인상, 김영식 장로 장립 / 이영순, 정대춘 집사 안수 / 노승례, 나상려, 김문옥, 한광숙 권사 취임

1996년 01월 06일

김남수 목사 금촌에 개척을 위해 사임

1996년 10월 08일

김진규, 김정렬 강도사 고려개혁 경기노회에서 안수 받아 교육목사 취임

1997년 04월 06일

유병국 장로 장립

1997년 09월 30일

김정렬 목사 경기도 용문에 베다니 공동체 교회 개척을 위해 사임

1998년 05월 05일

교회이전 10주년 기념 체육대회. 장소: 배화여중